Note of Pediatric Surgery

腸内細菌、R、ときどき小児外科

免疫

ELISAの測定結果をRで計算する 2. {drc}のインストールとGitHubからのデータのダウンロード

はじめに それでは、4パラメーターロジスティック曲線を描いて、回帰式からELISAの値を算出する、その前の下準備です。前回記事の続きです。 pediatricsurgery.hatenadiary.jp ELISAの測定結果をRで計算するために4パラメーターロジスティック曲線を使うまで…

腸内細菌の論文が読める様になりたい臨床医へ ( 2 ) レアファクション解析

はじめに 腸内細菌の論文を読み、多様性の話が出てくる時に避けて通れないのがレアファクション解析 ( Rarefaction解析 )。図表にしれっとグラフが登場するのに、material and methodsをきちんと読まないとあまり詳しく書かれていないレアファクション解析。…

ELISAの測定結果をRで計算する ( 3 ) 回帰式を使って濃度を求める

それでは実際に吸光度の値からIgAの濃度を求めていきたいと思います。4パラメーターlogロジスティック回帰の結果を見てみましょう。summary()を使用します。 [code lang=r] summary(LL4) [/code] で結果を抽出すると Model fitted: Log-logistic (ED50 as pa…

ELISAの測定結果をRで計算する ( 2 ) 4パラメーターロジスティック曲線を描く

それでは、4パラメーターロジスティック曲線を描いて、回帰式からELISAの値を算出していきましょう。Rっで4パラメーターロジスティック曲線を描く方法はいくつかあるようですが、drcパッケージを使用します。こちらのサイトを参考にさせていただきました。ち…

Gasteroenterology: γδ-T 細胞から産生されるIL-17と胆道閉鎖症

Interleukin-17, Produced by γδ-T Cells, Contributes to Hepatic Inflammation in a Mouse Model of Biliary Atresiaand is Increased in Livers of Patients. www.ncbi.nlm.nih.gov

腸内細菌叢の成長: 生後1000日の変遷

はじめに onlinelibrary.wiley.com 次世代シーケンサーの普及により腸内細菌叢の解析が進み、新生児期から乳児期を経て成人型に腸内細菌叢がどの様に変化し、免疫システムの構築、アレルギー疾患をはじめとした免疫システムの異常に伴う疾患との関係性が少し…

Bioanalyzer®に関するまとめ

Bioanalyzerに関する情報でまとまったものがなかったので、いろいろと調べたことをここに書いておきます。 1.Bioanalyzerとは? Bioanalyzer®・バイオアナライザはAgligent Technology社から発売されている、マイクロチップ型の電気泳動 ( 細胞分析 ) 装置で…

抗原摂取に伴うIgEシグナルの阻害は成立した食物アレルギーを脱感作し、Treg細胞を誘導する Immunity

Immunoglobulin E signal inhibition during allergen ingestion leads to reversal of established food allergy and induction of regulatory T cells. http://www.cell.com/immunity/fulltext/S1074-7613(14)00223-4?_returnURL=http%3A%2F%2Flinkinghub.…