Note of Pediatric Surgery

腸内細菌、R、ときどき小児外科

メタボローム解析

メタボローム解析: パッケージroplsのtutorialをやってみた

1. はじめに OPLS-DAを行う際の強力なツールとして、パッケージroplsの使い方をまとめていきます。OPLD-DAだけでなく、PCA、PLS(-DA),OPLSも行うことができ、R2とQ2によるquality metrics、permutation diagnosis、VIP valuesの計算、外れ値を計測するため…

メタボローム解析: PLS ( 部分最小二乗法 )

1. はじめに メタボローム解析を行う際に重要な解析方法である、PLS: 部分最小二乗法についてまとめてみました。参考サイトは8. 参考を見て下さい。