Atomのおすすめパッケージを一括インストールする

はじめに

研究をはじめてテキストエディタというものの存在を知り、markdownと出会いもありなくてはならない存在になったテキストエディタ。

CotEditor
Sublime3
Atom
hackmd.io kobito
MarkRight

と浮気しまくって最後にAtomに戻ってきました。自分用にAtomをインストールした後の設定を記録しておきたいと思います。

先天性横隔膜ヘルニアの重症度

解剖学的要素

• 胎生24週以前の胎児診断
• 出生前診断あり
• 重篤な合併奇形
• 右横隔膜ヘルニアが予後不良かどうかは議論の余地あり

超音波検査

小児鈍的脾・肝損傷: APSAガイドライン2000

0. はじめに

小児鈍的脾・肝損傷に関しては保存的治療が積極的に行われるようになっており、その割合は恐らく成人より高いのではないか？と思います。いわゆるbed rest protocolですが、どのくらいの期間、床上安静が必要なのか？ということは割と気にせず、ついついなんとなく安静にさせてしまうということも多いと思います。 ( 臨床感覚としてもあまり意味がないのでは？と感じることも多い )

今回はアメリカ小児外科学会 ( APSA ) が2000年に出したガイドラインに関する論文を読んでみたのでいくつか書いてみました。

Rで全角英数記号を半角にするのに{stringi}が役に立った話

はじめに ( 愚痴 )

仕事がらあまりデータ解析をしない人からExcelファイルをもらうことが多く、自分が扱いやすいデータにするための処理が実は解析の中で一番大変だったりします。もちろんExcelの生データをExcelを使って処理してしまえばそんなに大変ではないのですが、インフォマのはしくれとして御法度としています。解析のreoproducibilityというのは昨今の大きなテーマではありますが、後から見てどこをどう変更したのかが可視化できないデータの処理の仕方は、再現性を保証できませんし、何より後で自分が困ります。

なので、Rでスクリプトを書いてExcelを処理するのですが、その中の1つの大きな障壁が " 表記の揺れ " だと思います。半角と全角が混在する、大文字と小文字の使い方がバラバラなどなど。例えば、下でも書きますが ＡＳＴ（GOT ）みたいな記載が実際あるんですよ、うちの電子カルテから血液検査の結果を引っ張ってくるとそうなるんです。

そういうデータを作る人って本当に美的感覚がどうにかしてる ( 電子カルテだからプログラマーが関与してるはずなんだが ) 。

前置きが長くなりましたが、今回は全角と半角が混在したデータを半角のみに変換する方法をまとめてみました。久保先生のサイトでも話題になっていますが、割とめんどうくさいようですね。結論からいうと@yutannihilationさんから教えていただいた、stringi::stri_trans_nfkc()がベストだと思います。

KuboLog 2014-10-15

ジョージア旅情報: ワインの郷・カヘティ地方の情報

ジョージアワインを堪能すべくカヘティ地方へワイナリーを訪れる際の情報をまとめておきます。日本語の情報はあまりなかったので、お役に立てるかと思います ( 2017年9月の情報です ) 。ちなみにカヘティ地方のワイナリーの素晴らしさについては下記の記事を参照してください。

pediatricsurgery.hatenadiary.jp

ジョージア旅情報: ジョージアのワイナリーを巡る

ジョージアのワイナリーのワイン。めちゃくちゃ美味しかったので、ジョージアを訪れた際はなにがなんでも時間を作って行ってほしいです。

ジョージアがワイン発祥の地だということは有名だと思います。安宿でもワインが無料で振る舞われたりと、ワインが身近にあるのだということは知られていると思いますが、ワイナリーに関する情報が意外と少なくちょっと苦労しました。自分の経験を踏まえて情報まとめましたのでお役に立てればと思います。

1つはトビリシ市内にあるワイナリーの販売店。あと2つはジョージアのワインの名産地でもあるカヘティ ( Kaheti )　地方のクヴァラリ ( Kvarali ) というワイナリー。おすすめです。ちなみにいずれもTripAdvisorで高評価だったところを回っただけですが…。

カヘティ地方へのアクセス・宿・レストランの情報はこちらの記事を参照してください

pediatricsurgery.hatenadiary.jp

ジョージア旅情報: トビリシからメスティアまでのルートのまとめ

ジョージアの首都のトビリシからトレッキングで有名なスヴァネティ地方の玄関口のメスティアに行くには3通りあるようです。

1. バスでトビリシ→メスティア
2. 夜行列車でトビリシ→ズグディディ、バスでズグディディ→メスティア
3. 空路

それぞれに特徴があるのでまとめてみました。ちなみにスヴァネティ地方はジョージアのハイライトとしても知られており、行かないで素通りするなんて本当にもったいないです。

備忘録: 新しいMacを購入した時に

MacBook 12 inchを購入しました。今まで使用していたMacBook Pro 13 inch 2014をそのままコピーしても良かったのですが、怪しげなアプリケーションをたくさんインストールしてしまっているので、イチから環境設定をしてみます。完全に自分の備忘録で、次にクリーンインストールした時のために。最近は殆どの機能をウェブアプリにまかせているので、割と少なめ。

{dplyr}のパイプの中でNAを0に置換する

Rにおいて欠損値NAを0に変換するのは、Rを覚えたての頃につまづくことのうちの1つじゃないかと思います。いろいろ方法はあると思いますが、{dplyr}を使ってパイプの中で処理をする方法はあまり見つからなかったので、まだまだビギナーの自分にとっては結構大きい知見だったので共有しておきます。あまり大した知識ではないですし、常識なのかもしれないけど。

1. パイプ演算子を使わない方法

恐らく、パイプ演算子を使わないのならばこの方法が一番楽かと思います。

小児外科研修をはじめた人に贈りたいおすすめ参考書

小児外科

標準小児外科学 第7版 (Standard textbook)

おすすめ度 ☆☆☆☆☆ 小児外科専門医の筆記試験に合格するためには、これを丸一冊暗記すれば受かると言われて一生懸命読みました。確かに臨床上、最低限必要なことは記載されていますし、しっかりした本だと思います。ただ和書では系統小児外科学 の方が記載が多く内容も充実しており捨てがたいところですが、どうせ成書を買うなら下記のPediatric Surgeryを買った方がいいのでは？と思っています。

スタンダード小児外科手術

Operative Pediatric Surgery, Seventh Edition

Pediatric Surgery, 2-Volume Set: Expert Consult - Online and Print, 7e